Kochen Sie zunächst die Quinoa gemäß den Anweisungen auf der Verpackung.
Sobald sie gar ist, abgießen und unter kaltem Wasser abkühlen lassen.
Heizen Sie in der Zwischenzeit den Ofen auf 200–205 °C vor, bereiten Sie eine 12er-Muffinform vor und legen Sie sie mit Papierförmchen aus. (Anstelle der Form mit Papierförmchen können Sie auch eine Silikonform verwenden.)
Die abgekühlte Quinoa in eine Schüssel geben, zusammen mit Käse, Eiern, Frühlingszwiebeln, Tomaten, Backpulver, Salz und Pfeffer. Die Masse gründlich vermischen und anschließend die vorbereiteten Förmchen damit bis ca. ¾ ihres Volumens füllen.
Sobald der Teig verarbeitet ist, das Blech in den Ofen schieben und 23–24 Minuten bei 200–205 °C backen. Nach dem Backen die Muffins aus der Form nehmen, mindestens 20 Minuten abkühlen lassen und servieren.